Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Six6Q9QZ28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Six6Q9QZ28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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