Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Phtf1Q9QZ09 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Phtf1Q9QZ09 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms