Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndrg3Q9QYF9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms