Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rdh11Q9QYF1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rdh11Q9QYF1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms