Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapbQ9QY76 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VapbQ9QY76 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms