Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn4Q9QXZ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn4Q9QXZ9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms