Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms