Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apbb1Q9QXJ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms