Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lsm4Q9QXA5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lsm4Q9QXA5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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