Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Homer2Q9QWW1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms