Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkl2Q9QUK0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkl2Q9QUK0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms