Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PolkQ9QUG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms