Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms