Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms