Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sfmbt1Q9JMD1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfmbt1Q9JMD1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms