Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrfQ9JM73 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrfQ9JM73 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms