Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh9a1Q9JLJ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms