Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkd2l2Q9JLG4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkd2l2Q9JLG4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms