Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot9Q9JKY0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot9Q9JKY0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms