Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Upk3aQ9JKX8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms