Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Habp4Q9JKS5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Habp4Q9JKS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms