Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx5Q9JKQ4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx5Q9JKQ4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms