Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AtrQ9JKK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms