Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zfhx4Q9JJN2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zfhx4Q9JJN2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zfhx4Q9JJN2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfhx4Q9JJN2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfhx4Q9JJN2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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