Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Efcc1Q9JJF6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms