Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad9Q9JIW5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smad9Q9JIW5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms