Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnmb4Q9JIN6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms