Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tssc4Q9JHE7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tssc4Q9JHE7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms