Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm9sf3Q9ET30 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm9sf3Q9ET30 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms