Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ropn1Q9ESG2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms