Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
OtofQ9ESF1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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