Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ush1cQ9ES64 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ush1cQ9ES64 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms