Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp29Q9ES63 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp29Q9ES63 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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