Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trhr2Q9ERT2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trhr2Q9ERT2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms