Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms