Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms