Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms