Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn4aQ9ER60 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms