Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Barx1Q9ER42 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Barx1Q9ER42 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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