Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rapgef4Q9EQZ6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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