Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox9Q9EQM5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms