Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms