Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1lQ9EQ00 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ropn1lQ9EQ00 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms