Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Clstn1Q9EPL2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms