Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr88Q9EPB7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms