Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft1Q9DCN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms