Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt112Q9DCG9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt112Q9DCG9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms