Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xab2Q9DCD2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms