Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cbx6Q9DBY5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cbx6Q9DBY5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms