Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp4Q9DBY0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxp4Q9DBY0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms